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另，為什么知網查重報告文檔中一部分階段會將參考文獻標紅呢？這里有以下兩類理由，即一估計論文編者選用不正規的的知網查重系統對文章來查重，而這些不正規的的知網查重系統并不正規的的知網查重，因而無法鑒別參考文獻，造成參考文獻標紅；二是論文的參考文獻格式不正確，造成知網查重系統無法鑒別該部分參考文獻，進而將該參考文獻標紅，事實上，若該部分參考文獻格式準確就會知網查重鑒別，進而是不能夠攬入查重范圍左右。
綜上所述，知網查重并不包含參考文獻，知網查重一般而言只對論文的摘錄部分、英文摘錄部分、內容部分及附錄部分來查重，而參考文獻并不在知網查重范圍左右。故而，論文編者不必著急因應該需要羅列眾多參考文獻在論文中。但，僅有合規的知網方可鑒別參考文獻，并且其還有一個前置性條件就是參考文獻格式準確，這也正意味著論文編者必須到學術不端網的“知網查重入口”等合規的知網查重網站來查重，且要依據規定撰寫參考文獻，保障知網有機會鑒別。